自2002年X档案的六年后,前联邦捕快丹娜·斯科莉(吉莲·安德森 Gillian Anderson 饰)调任某教会病院担负医师,福克斯·穆德(大卫·杜楚尼 David Duchovny 饰)则过着隐居的生涯,持续着对超天然景象的存眷。某天,FBI捕快前来要求他们的赞助。本来一段时光内,维吉尼亚州接连稀有名男子奥秘失落,个中乃至包含一位联邦捕快。因为神甫约瑟夫(Billy Connolly 饰)宣称看到了犯法画面,是以FBI愿望对超天然案件有着丰硕经历的穆德和斯科莉帮助调查。但是跟着调查的深刻,穆德和斯科莉却发明案件的阴郁远远超越他们的设想。这对协作多年的错误面对着伟大的磨练…… 本片为同名美剧的第二部剧院版。